I principali compiti del 51° Stormo possono essere così sintetizzati:
Assicurare, sin dal tempo di pace, la difesa aerea dell'area di interesse nazionale, concorrendo al controllo dello spazio aereo relativo;
Supportare le esigenze di Forza Armata in piena integrazione Interforze e Interagenzia, assicurando capacità di Difesa Aerea, Ingaggio di Precisione, Ricognizione e Information Superiority;
Assicurare l'addestramento operativo dei piloti e la standardizzazione delle procedure d'impiego per la linea AM-X fino al termine del phase-out della linea